Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CftrP26361 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CftrP26361 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CftrP26361 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CftrP26361 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CftrP26361 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
CftrP26361 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CftrP26361 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CftrP26361 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CftrP26361 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CftrP26361 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms