Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd12P23812 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms