Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ggta1P23336 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ggta1P23336 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms