Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb9P20615 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxb9P20615 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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