Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PrkcaP20444 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms