Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PdgfaP20033 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PdgfaP20033 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PdgfaP20033 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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