Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NefhP19246 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NefhP19246 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms