Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ifrd1P19182 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms