Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnnc1P19123 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms