Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P18533 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P18533 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18533 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18533 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms