Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18530 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18530 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18530 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms