Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PtpraP18052 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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