Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Hoxb1P17919 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms