Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Kcna1P16388 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms