Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Vpreb2P13373 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Vpreb2P13373 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms