Protein–RNA interactions for Protein: P11276

Fn1, Fibronectin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fn1P11276 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Fn1P11276 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fn1P11276 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fn1P11276 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Fn1P11276 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Fn1P11276 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fn1P11276 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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