Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PolP10400 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PolP10400 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PolP10400 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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