Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TtrP07309 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TtrP07309 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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