Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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H2-Eb1P04230 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
H2-Eb1P04230 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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