Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01649 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms