Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ccl20O89093 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ccl20O89093 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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