Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a20bO88575 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a20bO88575 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a20bO88575 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a20bO88575 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc6a20bO88575 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc6a20bO88575 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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