Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp2O88554 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp2O88554 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms