Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Copb2O55029 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms