Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SlkO54988 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SlkO54988 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SlkO54988 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlkO54988 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms