Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Zmat3O54836 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms