Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffaO54786 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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DffaO54786 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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DffaO54786 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DffaO54786 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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DffaO54786 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffaO54786 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DffaO54786 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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