Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EdaO54693 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EdaO54693 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
EdaO54693 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms