Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Opn1mwO35599 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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