Protein–RNA interactions for Protein: O35405

Pld3, Phospholipase D3, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld3O35405 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pld3O35405 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pld3O35405 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms