Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc18a3O35304 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms