Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ArxO35085 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ArxO35085 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ArxO35085 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms