Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GclmO09172 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GclmO09172 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GclmO09172 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GclmO09172 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GclmO09172 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GclmO09172 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GclmO09172 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GclmO09172 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms