Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Eftud2O08810 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms