Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccer2J3QPU5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccer2J3QPU5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms