Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc180J3QNE4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc180J3QNE4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms