Protein–RNA interactions for Protein: J3QMN6

Fmo6, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo6J3QMN6 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fmo6J3QMN6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms