Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms