Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf148G3X9R7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf148G3X9R7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf148G3X9R7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf148G3X9R7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf148G3X9R7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms