Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm15477-202ENSMUST00000143945 2351 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Olfr221-204ENSMUST00000216188 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Gm20604F8WIA3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms