Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
N4bp2F8VQG7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
N4bp2F8VQG7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms