Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colca2F8VPY8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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