Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Arid4aF8VPQ2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arid4aF8VPQ2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Arid4aF8VPQ2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arid4aF8VPQ2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms