Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pagr1bF6V0H0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms