Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
R3hdm1E9Q9Q2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms