Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gcom1E9PZ54 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.3 ms