Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm3298E9PW80 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm3298E9PW80 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Gm3298E9PW80 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3298E9PW80 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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