Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ccdc175E9PVB3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms