Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clca3bE9PUL3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms