Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gm17333C6EQI3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Gm17333C6EQI3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gm17333C6EQI3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm17333C6EQI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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